El MEF destaca por su intensa actividad científica y por el equipo de investigadores y técnicos especializados que trabajan en diversas áreas de la paleontología. Sus estudios y descubrimientos han aportado información clave sobre la evolución de la vida en la región. El museo lleva el nombre del naturalista y geólogo italiano Egidio Feruglio, quien realizó importantes investigaciones en la Patagonia y dejó un legado fundamental para la ciencia argentina.

El recorrido del Egidio Feruglio comienza con la presencia humana en la Cueva de las Manos, en Santa Cruz, y avanza hacia atrás en el tiempo hasta llegar al Big Bang y el origen del Universo. El museo abrió sus puertas el 28 de diciembre de 1990 en un pequeño edificio de 700 metros cuadrados ubicado en la calle 9 de Julio, donde trabajaban únicamente tres personas: el director, un técnico paleontológico y un empleado administrativo. La necesidad de crecer llevó a la creación, ese mismo año, de la Fundación Egidio Feruglio, encargada de gestionar recursos y apoyar el desarrollo institucional.

La Fundación, junto con el CONICET y la Municipalidad de Trelew, constituye el soporte institucional del MEF, que funciona bajo un modelo de gestión no gubernamental. Poco después de su apertura, el museo fue declarado de Interés Turístico Provincial y se firmó un acuerdo que autorizó al MEF a realizar actividades de prospección, extracción y puesta en valor del patrimonio paleontológico de Chubut. Gracias a estos proyectos, el museo atrajo a destacados paleontólogos de todo el mundo.

En 1994, el Egidio Feruglio organizó su primer gran evento internacional: el VI Congreso Internacional de Paleontología y Bioestratigrafía, acompañado de dos seminarios dedicados a la paleobiología de plantas fósiles y a los dinosaurios de Gondwana. Más de 250 investigadores de 19 países participaron en este encuentro, que consolidó al museo como un centro científico de relevancia global.

El crecimiento del MEF continuó y, en 1999, inauguró su sede actual, un edificio de 3.000 metros cuadrados diseñado por arquitectos de la Municipalidad de Trelew con asesoramiento del propio museo. Esta obra se convirtió en uno de los proyectos museísticos más importantes de Argentina en las últimas décadas. Poco después, el Ministerio de Educación de la Nación declaró al museo de Interés Educativo, y varias ciudades del país hicieron lo mismo.

En 2012, el museo fue homenajeado con la designación de la especie Eoabelisaurus mefi, cuyo nombre reconoce al MEF y al paleontólogo Diego Pol, uno de sus descubridores. Dos años más tarde, el 16 de mayo de 2014, el museo presentó uno de los hallazgos más espectaculares de la paleontología moderna: un nuevo titanosaurio considerado el animal terrestre más grande conocido. Este descubrimiento impulsó el proyecto “Una casita para el dinosaurio”, destinado a ampliar el edificio para albergar la réplica del gigantesco saurópodo.

El Egidio Feruglio combina investigación de vanguardia con un diseño expositivo moderno. Su recorrido incluye una línea de tiempo que guía al visitante desde los primeros habitantes de la Patagonia hasta los microorganismos más antiguos. La sala dedicada a la era Mesozoica es uno de los puntos más atractivos del museo, con fósiles y reconstrucciones de dinosaurios patagónicos. Una proyección en el microcine completa la experiencia, llevando al público hasta el origen mismo del Universo.